מרבית החומר סביבנו אינו מורכב מאטומים בודדים המרחפים להם בנפרד זה מזה, כי אם מצברי אטומים המכונים "מולקולות". הקשרים בין האטומים בתוך המולקולות והקשרים בין מולקולה אחת לשנייה קובעים במידה רבה כיצד ייראה החומר, אם יהיה מוצק, נוזל או גז ותכונות רבות נוספות.
